A versão do pidgin instalada no ubuntu 9.04 é a 2.5.5. No momento em que escrevo esse post a versão mais nova  é a 2.6.1.
Nela é corrigido entre outras coisas um problema de conexão com o yahoo.
Oficialmente o pessoal do ubuntu não costuma disponibilizar versões mais novas dos aplicativos nas distribuições, a menos que as correções sejam por conta de algum problema de segurança.
Se você deseja fazer a atualização para essa versão de maneira rápida e fácil, execute os seguintes passos:

1) Inclua no final do arquivo /etc/apt/sources.list a seguinte linha:
deb http://ppa.launchpad.net/pidgin-developers/ppa/ubuntu jaunty main

2) Importe a chave de validação do novo repositorio executando no terminal o seguinte comando:

sudo apt-key adv –recv-keys –keyserver keyserver.ubuntu.com 67265eb522bdd6b1c69e66ed7fb8bee0a1f196a8 (aqui antes de recv e de keyserver tem 2 traços; o wordpress coloca apenas um então por gentileza apenas corrija na hora de copiar e colar no terminal)

3) Execute os seguintes comandos para atualizar:
sudo apt-get update && sudo apt-get upgrade

Com isso você instala a versão mais nova do pidgin e toda vez que uma nova for liberada ela vai aparecer na lista dos aplicativos para ser atualizada.